目前，EDI超纯水设备膜堆的运行方式基本上有三种。

　　1、直进式：初级纯水分成三股，分别进入EDI膜堆的淡水室、浓水室和极水室。

　　2、浓水循环式：浓水加盐循环部分自成系统，由循环水箱、泵、加盐系统、管道和控制系统等组成，初级纯水在进入EDI膜堆的淡水室的同时分出一部分进入循环水箱，由循环泵加压进入EDI膜堆的浓水室和极水室，再循环过程中，浓水需要部分排放，以使循环水箱中的盐浓度保持不变，这样必须控制进入循环水箱的初级纯水的量与排放量相同。